蝌蚪

快速鉴别犬细小病毒和猫细小病毒的PCR

发布时间:2022/4/30 17:52:49   
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背景

依据国际病毒分类委员会的最新划分,犬细小病毒(Canineparvovirus,CPV)和与其亲缘关系密切的猫细小病毒(Felineparvovirus,FPV)同属于细小病毒亚科(Parvovirinae)、原细小病毒属(Protoparvovirus),肉食动物原细小病毒1型种(Carnivoreprotoparvovirus1)成员。

犬细小病毒主要感染犬科动物,其致病性强,致死率高,对我国军犬、警犬、观赏犬及家养犬的饲养造成了巨大的威胁。猫细小病毒是危害我国猫科、浣熊科和鼬科等多种家养、圈养、野生和经济动物的主要传染病病原体之一。

图片来源于网络

CPV和FPV的基因组同源性达98%以上。有报道称CPV是FPV的宿主迁移毒株,是FPV适应新的野生肉食动物宿主进化而来。也有研究表明FPV和CPV来源于同一个祖先,适应野生动物而分离进化而来。CPV比FPV有更快的变异速率,它们分别以每年1.7×10-4和9.4×10-5个亚基变化的速率变异。

目前对CPV和FPV的鉴别的已建立的实验方法有:PCR扩增,血凝和血凝抑制试验,免疫荧光法,酶联免疫法等传统诊断方法,存在准确率低,耗时等问题,且较适用于中后期病毒滴度高时诊断。也有针对VP2基因单核苷酸多态性位点设计引物和探针,建立FPV和CPV鉴别检测的TaqManMGBreal-timePCR方法,但序列的保守性非常影响试验结果。

因此,广州维佰生物针对VP2基因特点,选取有稳定碱基变异的片段,建立了一种容易操作,数据自动分析,从获得样本到获取结果,仅需约3h即可区分CPV和FPV感染的高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)方法。

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技术要点

广州维佰生物研发的犬细小病毒和猫细小病毒PCR-HRM鉴别分型试剂盒融合了PCR和HRM分析技术,基于FPV和CPV的一段存在稳定的多个单核苷酸位点变异的基因片段设计一对特异引物,在PCR反应后进行HRM分析,CPV和FPV有不同的熔解温度(Meltingtemperature,Tm),通过简单对比,即可快速判定样品为CPV还是FPV毒株。

该技术需在具有HRM分析功能的荧光定量PCR仪上进行(如ABIStepOne荧光定量PCR仪)。本试剂盒与实验室建立的FPV和CPVTaqManMGBreal-timePCR鉴别方法对临床样品的检出符合率为%。

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技术应用

利用犬细小病毒和猫细小病毒PCR-HRM鉴别医院及猫舍送样进行检测,均能有效区分。

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